課程資訊
課程名稱
蛋白質泛素化修飾特論
Special Topics on the Ubiquitin Modification System 
開課學期
112-2 
授課對象
生命科學院  生化科學研究所  
授課教師
吳昆峰 
課號
BChem5053 
課程識別碼
B46 U1130 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期一3,4(10:20~12:10) 
上課地點
生化N101 
備註
初選不開放。
總人數上限:15人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程介紹並深度探究泛素化的生化反應機制與近期學術相關的研究。授課方式以每週主題講述,並提供該週相關研究文章作為討論的內容。修課同學於該學期內閱讀20篇相關學術文章,了解泛素化的功能、結構與修飾機制。評分方式將以課堂上參與程度、圓桌討論時對文獻與課堂知識的理解程度以及期末考為三個部分進行評分。期末考將以問答方式測驗。 

課程目標
訓練學生閱讀英文期刊文章,了解最近期的學術研究進度。
訓練學生在文章閱讀時,對實驗的設計、執行方式與結果進行考核與思考。
提供學生不同的視野,可將課堂上介紹的實驗技術/平台應用於個人研究。
 
課程要求
具有生化相關課程的基本知識 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
指定相關論文與每週教學投影片 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
02/19  Introduction of Ubiquitin, PTM and other UBLs, protein homeostasis, role of cysteine in chemical reactions 
第2週
02/26  The E1 activation enzyme:
• Structural elements
• Chemical reaction, mechanism, and function 
第3週
03/04  Round table paper discussions (1) 
第4週
03/11  "The E2 conjugase:
• core structure and function
• canonical/non-canonical E2 conjugase
• role of backside binding
• N-terminal acetylation and activity" 
第5週
03/18  The E3 ligase (1): RING E3: function, structure, mechanism and case studies 
第6週
03/25  The E3 ligase (2): HECT E3: function, structure, mechanism and case studies 
第7週
04/01  The E3 ligase (3): RBR E3 (vs HECT, vs RING, the ubiquitin relay): function, structure and case studies 
第8週
04/08  "Ubiquitin chain (types, genration, and detection)
Deubiquitinase (DUB: function, structure, and mechansim)" 
第9週
04/15  "Deubiqutinase (continued)
Proteasome structure and function" 
第10週
04/22  "Other ubiquitin-like proteins (UBL)
• SUMO
• NEDD8 and crosstalks to Culin RING E3 ligase
• ISG15 and other UBLs
• Autophagy
• Viral/pathogenic ubiquitin-like system " 
第11週
04/29  "Ubiquitin probes and engineering
• Chemical probes for ubiquitin
• Ubiquitin variants
• advanced tools
• Ubiquitin and protein condensate (LLPS)" 
第12週
05/06  "Ubiquitin, diseases and drug discovery:
• PROTAC and protein degradation
• Inhibitor Drugs for E1, or E2
• Cognate-selected ubiquitin variants
• Selectivity and specificity of small molecular inhibitors" 
第13週
05/13  Round table paper discussions (2) 
第14週
05/20  Final Exam: Case representation (1) 
第15週
05/27  Final Exam: Case representation (2) 
第16週
06/03  Final Exam: Case representation (3)